توفر أكاديمية القادة الدولية مختبرات علمية مجهزة بكافة الوسائل التعليمية الحديثة والأدوات والمواد والتجهيزات المخبرية التي تمكن الطلبة من تعلم العلوم كمعرفة وطريقة في آن واحد.
حيث يدرب الطلبة على مهارات عملية لممارسة عمليات العلم من جمع للحقائق وعرض المعلومات ومعالجتها ثم وضع الفرضيات وتصميم التجارب والتحقق منها ثم التواصل الى الاستنتاجات والتصميمات، فطالب أكاديمية القادة الدولية عالم وباحث صغير ليكتسب الخبرات الحسية المباشرة عند تعامله مع العينات الحية أو المحفوظة أو عند تعامله مع النماذج والمجسمات والمصورات واللوحات والمخططات، إضافة الى إمكانية استخدام الزجاجيات و الأجهزة و الكيماويات و الكواشف لإجراء التجارب العملية في جو يسوده معايير الأمن و السلامة على أيدي أمهر المعلمين و المعلمات و الكوادر الإدارية. يوجد في الأكاديمية ستة مختبرات علمية تشمل مختبرات العلوم الطبيعية و العلوم الحياتية و العلوم العامة لكافة المراحل الدراسية بما يتناسب، و طبيعة المرحلة.
